通常情况下碘伏中不含有刺激性物质，所以碘伏涂擦伤口通常不疼。但如果对疼痛较为敏感，在涂擦时用力过大，触碰伤口则可能产生轻微疼痛，一般机体可以耐受。
碘伏为聚维酮碘溶液，具有较广泛的杀菌效果，可起到一定杀灭物品表面细菌、真菌、部分病毒的作用。日常用于涂擦伤口的为医用碘伏，相比普通碘伏浓度较低、刺激性较小。如果出现皮肤受损，可在医生指导下使用医用碘伏涂擦进行消毒。碘伏中不存在刺激性物质，涂擦于伤口周围皮肤通常不会对皮肤组织产生刺激或引起疼痛，故通常使用碘伏涂擦伤口不会疼。但部分皮肤损伤程度较严重，或对疼痛较敏感的人群，使用碘伏涂擦伤口，对周围组织产生轻微刺激，可能引起轻微疼痛。
如果出现皮肤外伤，出现烧伤、擦伤等，可在医生指导下使用医用碘伏对伤口表面进行消毒，避免发生感染。但应避免盲目使用浓度过高的碘伏，以免损伤皮肤。如皮肤破损程度面积较大、伤口较深，除进行消毒外还需及时接种破伤风疫苗，避免感染破伤风杆菌引起破伤风。此外，还需注意，部分人可能对碘伏成分过敏，擦涂后出现瘙痒或者局部皮肤红疹等情况，应立即暂停使用并使用 流动清水冲洗。