正确使用甲硝唑凝胶一般不会出现耐药的情况，也不会对身体健康造成伤害，但如果长时间或者大量使用甲硝唑凝胶，可能会出现耐药性。
甲硝唑凝胶属于局部外用药，主要的成分是甲硝唑，甲硝唑具有抗厌氧菌的作用，作用机制为阻碍细菌代谢，促其死亡，可以用于炎症性丘疹、脓疱疮、酒糟鼻红斑的局部治疗。少数患者使用此药后会出现皮肤干燥、烧灼感、皮肤刺激等过敏反应，但遵医嘱用药一般不会出现耐药性。甲硝唑凝胶属于抗生素类药物，如果未严格遵照医嘱使用甲硝唑凝胶，自行盲目使用可能会导致耐药性，使药物的治疗效果有所下降，对于疾病的治疗造成不利影响。
使用甲硝唑凝胶前应先清洗患处，再将药物涂抹于患处，避免药物接触眼睛和其他黏膜，如口、鼻等。对甲硝唑凝胶过敏者，以及孕妇、哺乳期妇女应禁用此药，儿童应慎用。
如果存在上述皮肤疾病，建议患者到正规医院的皮肤科就诊，进行视诊、皮肤镜检查等明确诊断。如果使用该药物后出现用药部位烧灼感、红肿等情况，需要立即停药并就医，遵医嘱更换其他药物治疗。