一觉睡醒嘴巴发酸可能是由非疾病性因素所导致，也可能是由疾病性因素导致，如口腔溃疡、反流性食管炎、慢性胃炎、十二指肠溃疡、幽门梗阻、糖尿病等疾病，可在医生指导下进行药物治疗或手术治疗等。
一、非疾病性因素：
若在睡觉前进食过酸、过甜的食物，比如杨梅、柠檬等，会在口腔内遗留酸性物质和糖分，酸性物质会刺激口腔内残留食物残渣发酵，糖分被口腔细菌分解、发酵也会变酸，从而睡醒后出现嘴巴发酸的症状，若没有其他症状，不需要进行特殊治疗，在睡觉前应减少摄入过酸食物即可。
二、疾病性因素：
1、口腔溃疡：口腔溃疡一般是免疫力下降、精神压力较大、营养物质摄取不均衡等原因所导致，患者发病时细菌会在口腔内大量繁殖，口腔环境改变，可能会使患者睡醒口腔发酸，还会出现明显疼痛、充血、水肿等症状，患者可使用西地碘含片、复方氯己定含漱液、口腔溃疡散等药物进行治疗。
2、反流性食管炎：反流性食管炎多与胃排空延迟、食管感觉异常等因素有关，导致胃内容物蓄积上逆，也可能是贲门松弛，从而导致抗反流能力下降，胃酸上逆，在睡觉平躺时症状会加重，使患者出现反酸的症状，还会出现烧心、上腹痛等症状，患者可使用注射用艾司奥美拉唑钠抑制胃酸、西沙必利片促进胃肠蠕动治疗，如果药物治疗无效，还可遵医嘱进行手术治疗，比如腹腔镜胃底折叠术。
3、慢性胃炎：慢性胃炎一般是感染幽门螺杆菌所导致，患者发病时会分泌过多的胃酸，当患者处于平躺体位时，会导致胃酸反流，从而会导致患者出现一觉睡醒嘴巴发酸的症状，还会出现食欲减退、上腹隐痛等症状，患者可使用胶体果胶铋胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片等药物抑制胃酸治疗，还可进行手术治疗，比如胃镜下行黏膜下剥离术、黏膜切除术等。
4、十二指肠溃疡：该疾病发生常与胃酸分泌异常、幽门螺杆菌感染、生活及饮食不规律等因素有关，患者胃内胃酸分泌过多，可能夜间睡眠时胃内胃酸过多上逆，会导致嘴巴酸，可能还会伴有嘴巴干燥、发苦的现象，患者可以应用枸橼酸铋钾胶囊保护消化道黏膜，并使用莫沙必利片促进胃肠蠕动向下排出胃酸，或使用奥美拉唑肠溶胶囊抑制胃酸分泌等药物治疗。
5、幽门梗阻：幽门是消化道最狭窄的部位，容易发生梗阻。由于幽门通过障碍，胃内容物不能顺利入肠，而在胃内大量潴留，患者会出现反酸、呕吐等症状。患者可以使用促进胃蠕动的药物，如枸橼酸莫沙必利片、多潘立酮片、西沙必利片等，或使用胶体果胶铋胶囊、雷贝拉唑钠肠溶片等药物抑制胃酸分泌。若是药物治疗无效，则需要行手术解除梗阻。
6、其他：糖尿病也可能导致一觉睡醒嘴巴发酸，建议及时到医院就诊，使用阿卡波糖片、盐酸二甲双胍片等降糖药物治疗。
造成一觉睡醒嘴巴发酸的原因有很多，如有症状可先观察一段时间，若还伴随其他症状，应及时到医院内科就医，通过胃镜检查、血常规检查等明确病情，确诊后在医生的指导下进行治疗。平时应养成良好的口腔习惯，做到饭后漱口，早晚刷牙。