结膜充血一般需要根据具体的病因选择眼药水，一般可以遵医嘱使用缓解疲劳的眼药水、抗细菌眼药水、抗病毒眼药水、抗过敏眼药水等。
1、缓解疲劳的眼药水：如果长时间使用眼睛，眼睛比较疲劳，就会导致结膜充血，还可能会有酸痛感，建议听从医生建议使用七叶洋地黄双苷滴眼液、托吡卡胺滴眼液等。
2、抗细菌眼药水：当结膜感染细菌之后，一般会出现充血、分泌物增多等症状，需要在医生的指导下使用盐酸林可霉素滴眼液、妥布霉素滴眼液等药物。
3、抗病毒眼药水：病毒侵入结膜后，也会引起充血、疼痛等症状，可以遵医嘱使用阿昔洛韦滴眼液、利巴韦林滴眼液等进行治疗。
4、抗过敏眼药水：结膜接触到过敏原，比如尘螨、花粉、柳絮等，就会出现充血、瘙痒、流泪等症状，可以根据医生建议使用富马酸依美斯汀滴眼液、盐酸氮䓬斯汀滴眼液等。
除此之外，还可能需要使用抗真菌眼药水、糖皮质激素类眼药水，如那他霉素滴眼液、妥布霉素地塞米松滴眼液等。如果长时间结膜充血，还有可能是高血压引起的，此时只使用眼药水效果不佳，需要听从医生建议服用硝苯地平片、 盐酸维拉帕米片等药物。