临床一般没有丝状疣最佳治疗药膏的说法，如果患有丝状疣，通常可以使用外涂的药物，比如抗病毒药物、抗肿瘤药物、维甲酸药物等进行治疗。如果药物治疗效果不佳，还可以遵医嘱根据实际情况选择激光、冷冻等治疗方式。
1、抗病毒药物：丝状疣是生活中比较常见的皮肤病，由病毒感染引起。通常会出现在颈部、面部，主要表现就是疣体细长，皮肤表面会明显隆起，有角质层产生，呈乳头瘤样，影响皮肤的美观程度。可遵医嘱选择咪喹莫特乳膏、重组人干扰素α2b凝胶、喷昔洛韦乳膏等药膏，由于丝状疣一般是人乳头瘤病毒感染导致的，可以使用抗病毒药物对抗病毒感染，对病情有一定帮助。
2、抗肿瘤药物：如氟尿嘧啶乳膏，可以起到抑制病毒DNA合成的作用，可以使其生长繁殖受到影响，从而达到治疗效果。
3、维甲酸类药物：如维A酸乳膏、阿达帕林凝胶、他扎罗汀乳膏等，可以促进局部皮肤细胞的分化与生长，可以使过度角化受到抑制，从而达到一定的缓解作用。
4、其他：还可以选择五妙水仙膏、丹皮酚软膏、龙珠软膏等药物进行治疗，还可以局部应用注射用盐酸平阳霉素等药物进行治疗。此类药物使用的时候效果通常有限，并不能达到最佳治疗目的。
如果丝状疣比较严重，对正常皮肤组织产生的危害比较大，需及时至皮肤科就诊，完善体格检查、组织病理检查等，确诊后可以在医生指导下使用药物或选择液氮冷冻、电灼、激光等方式进行治疗，效果比较明显。
此外，丝状疣具有传染性，平时生活中还需要养成良好的生活习惯，保持疣体部位卫生干净，定期进行消毒处理，避免抓挠患处。药物使用期间需要注意观察，有任何异常症状，就需要及时去医院皮肤科就诊。