尿有咖啡味主要考虑与非疾病因素和疾病因素有关，非疾病因素主要有摄入咖啡过多和饮用浓度过高的咖啡，疾病因素主要有泌尿系统感染、急性肾小球肾炎、急性肾衰竭等。
一、非疾病因素：
咖啡属于饮品的一种，里面含有芳香性物质以及兴奋性物质，芳香性物质包括呋喃类化学物质。如果摄入过多或过浓，不能够被肾小球过滤和肾小管完全吸收，便会从尿液中流出，从而引起尿有咖啡味，属于正常的生理现象，一般不需要进行特殊治疗。
二、疾病因素：
1、泌尿系统感染：常见于尿道炎、膀胱炎等，主要是由于病原菌侵犯尿路引起的，由于病原菌不断繁殖滋生，所以尿味比较严重，也会引起尿有咖啡味。一般确诊有尿路感染，需要在医生指导下使用抗菌消炎类药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊等。
2、急性肾小球肾炎：急性肾小球肾炎会导致肾小球滤过膜受损以及肾功能损害，喝完咖啡后不能立即代谢干净，咖啡随尿液排出体外，所以会引起尿有咖啡味，需要遵医嘱服用药物，比如甲泼尼龙片等。
3、急性肾衰竭：主要指短时间内肾脏功能快速衰退，主要表现为少尿、浮肿等 症状，由于肾脏功能受损，代谢功能下降，也会引起喝完咖啡尿有咖啡味，可以在医生指导下注射呋塞米注射液等。
尿有咖啡味时，建议患者及时前往医院泌尿外科就诊并完善尿常规检查等。平时可以适当喝咖啡，但不建议一次性摄入量过大，尤其不建议睡前饮用。