若长期服用鸡内金，可能会损害肝肾、胃内组织，甚至还会诱发肝肾病变，对自身健康不利。患者不要自行加减药物剂量，应遵照中医医生的指导按量、按疗程服用，有助于病情好转。
鸡内金性平，归脾经、胃经、膀胱经，可护养脾胃、消除积食、涩精止遗，能改善饮食积滞、遗精、遗尿、泄泻等异常症状。若自身存在上述现象，则可以在医生指导下服用鸡内金缓解症状，当病情好转后，可遵医嘱逐渐减少药物用量、直至停药。
若病情已经好转，还长期或频繁服用鸡内金，多会使身体中药物堆积过多，胃肠来不及消化、肝肾未能及时代谢后，也许就会继发呕吐、腹泻、胃胀等胃肠道不良反应，以及水肿、身体无力、头晕等肝肾亏虚现象。综上所述，鸡内金不能长期服用。
鸡内金还能在医生指导下与五味子、干葛等其他中药材配伍使用，进而更好地调治疾病。日常应合理调整饮食，避免暴饮暴食，饮食应清淡，适当进食苹果、鱼肉、豆浆等高营养食物，并合理进行打羽毛球、瑜伽、慢跑等运动，从而在一定程度上辅助身体好转。