做CT对人体的危害主要包括辐射损伤，CT检查利用X线透过人体后由计算机重建产生图像，检查过程中会出现电离辐射，对人体造成损伤。但是正常遵医嘱进行规范的检查，辐射剂量在安全范围内，不会产生严重影响。
电离辐射对人体会产生很多种的生物效应，主要分为随机性效应和确定性效应。随机性效应是指人体在接受电离辐射后有可能会导致一定的致癌效应和遗传性效应，但是没有固定阈值，通常检查剂量大时会出现，可能会造成白血病、甲状腺癌等。
确定性效应存在一定的阈值，当患者接受到一定的剂量时会产生的辐射危害，如暂时不育、永久不育或皮肤损伤等。但是检查过程中辐射剂量在安全范围内，无需过于担心。但是备孕期或者怀孕的女性不应进行CT检查，避免对胚胎造成损伤。
另外，做增强CT还要在体内注入对比剂，可能会对肾功能有一定损伤，所以肾功能不全以及自身对对比剂存在过敏者，应提前告知医生，此时不可以做检查。做完增强CT后还应在放射科附近观察0.5-1小时，以免出现不适。同时还应大量饮水，及时排尿，促使对比剂排出。