嘴里长透明水疱，可能与黏液腺囊肿、口唇疱疹、天疱疮、外伤、过敏性口炎等因素有关，如果长时间未见缓解，建议及时至医院口腔科就诊。
1、黏液腺囊肿：由于口腔内部受到损伤或导管系统阻塞，导致口腔黏膜下出现质软透明水疱，破溃流出黏稠液体，但易反复形成囊肿后不再透明，一般通过手术切除治疗，也可应用碘酊治疗，将囊液抽出后注入碘酊，停留几分钟后再抽出，避免囊腔形成。
2、口唇疱疹：由于疱疹病毒感染导致，口腔黏膜出现透明水疱，可伴有灼热疼痛感，多为聚集性水疱，可遵医嘱应用抗病毒药物，如喷昔洛韦乳膏、阿昔洛韦片等药物进行治疗。
3、天疱疮：由于自身免疫系统功能紊乱诱发，可在口腔出现透明水疱，还可好发于胸背、头部等部位，疱壁较薄，易破溃，可伴有疼痛。可使用生理盐水擦拭黏膜破溃处，口含醋酸泼尼松龙片改善临床症状。
4、外伤：由于经常咬唇、牙套频繁摩擦，或食用过烫的食物烫伤口腔黏膜，可能导致口腔黏膜表皮分离，出现透明水疱，注意避免不良习惯，做好局部黏膜护理，避免感染，可应用碘伏消毒或生理盐水漱口，短时间内即可恢复。
5、过敏性口炎：可能由于药物或接触其他过敏物质导致口腔黏膜出现透明水疱，局部可伴有充血、发热、肿胀等情况，此时需规避过敏物质，应用盐酸西替利嗪片、氯雷他定片等药物进行抗过敏治疗。
此外，中医认为肝胆火旺者也可出现嘴里长透明水疱的现象，建议由专业中医进行辨证论治后使用药物改善不适。日常应注意口腔清洁，避免长期进食辛辣刺激性食物，适量饮水，促使病情好转。