如果只是偶尔一次出现夹腿综合征并不会对机体产生明显危害，但如果经常或频繁出现，则可能会对心理造成危害，还会对身体造成危害，甚至出现泌尿系统感染的并发症。
1、心理危害：夹腿综合征是通过夹腿或者摩擦，导致会阴部位引起兴奋的一种行为，通常是局部受到刺激或者心理因素所影响。患者会出现情绪紧张或者面部潮红，还会引起目光凝视，甚至全身出汗，如果在儿童生长发育期间出现此情况，还可能会出现自卑或者恐惧、紧张等情绪，所以可能影响到儿童心理发展，并影响正常社交能力。
2、身体危害：夹腿综合征如果长期存在可能会导致身体受到危害，容易导致分泌物增多，频繁接触手、裤子、床单等还容易引起细菌感染，容易导致阴蒂、阴唇、阴茎等出现疾病，可能会对生殖和泌尿系统健康造成影响，如果是孩子，长大后还可能出现性功能异常。
因为病情的严重程度不同，所以出现的危害也存在一定不同，为避免不断加重影响身体和心理健康，所以要及时通过心理、行为干预进行治疗，如行为疗法或者认知疗法等。