利巴韦林制剂有明确的致畸性和杀胚胎作用，因此不仅孕期不能使用，备孕前6个月内男女双方均不能使用，如果近期有用药史而且意外怀孕，通常建议终止妊娠。
利巴韦林的临床制剂种类较多，比如片剂、胶囊、注射液、颗粒等，无论使用何种剂型，药物在人体内残留时间较久，通常停药4周也不能完全清除。研究调查表明，使用利巴韦林制剂的孕妇，胎儿发生畸形的概率明显增加，而且可能出现多系统畸形，已经发现的有颅脑、腭、眼、四肢、骨骼、胃肠道等器官畸形。
除已经怀孕的妇女，处于备孕阶段的夫妻双方，也不能在备孕6个月之内使用该药物，因为其有伤害睾丸、精子的作用。因此，如果使用了这种药物，有备孕需求，应在用药6个月之后再怀孕，以免引发胚胎畸形、不良妊娠结局等。
孕妇有利巴韦林用药史，但是孕检尚未明确发现胎儿有畸形情况，也需要加强监测，以严密观察其发育是否健康。孕前、孕期用药均有严格要求，因此孕妇有用药需求，应详细咨询医生或仔细阅读药物说明书，以免引发不必要的伤害。