如果疣体比较小或者个人对药物的吸收能力比较快，使用咪喹莫特乳膏祛疣效果会比较好，反之祛疣效果可能会差一些，可选择其他方法治疗。咪喹莫特乳膏祛疣效果具有个体差异性，每个患者对药物的吸收能力不同，病情严重程度不一样，治疗效果可能会有一定的差别。
咪喹莫特乳膏的主要成分是咪喹莫特，咪喹莫特能在用药局部诱导生成多种细胞因子及相关产物，从而产生免疫调节和间接抗病毒作用，主要用于治疗外生殖器和肛周尖锐湿疣。如果疣体比较小，比如小于1cm，疣体比较少，个人对药物的吸收能力比较快，通常祛疣效果比较明显，涂抹药物后能够使疣体快速脱落、清除，减少疣体扩散。
部分患者的疣体相对来说体积比较大，或者是发生在比较隐蔽的部位，比如肛门，疣体数量比较多，如2-3个，机体对药物的吸收能力比较差，用药后可能效果不是特别明显，达不到完全根治的作用，患者可以选择激光治疗、液氮冷冻治疗、手术切除等方式去除疣体。
应用咪喹莫特乳膏治疗期间可能会产生皮肤红斑、水肿、糜烂、溃疡等不良反应，患者需要减少或停止使用。若自身出现长疣体的情况，应 及时到医院皮肤性病科就诊，完善视诊、醋酸白试验、皮肤镜检等检查明确疣体的类型。