舌头根部有红色的凸起的痘痘可能是由舌头烫伤、舌乳头炎、口腔溃疡、口腔尖锐湿疣，以及舌根部淋巴滤泡增生、咽喉炎、舌头疱疹等情况引起，一般可通过药物治疗、手术治疗、物理治疗等方式改善。
1、舌头烫伤：进食过热的食物、水，可能会使舌头黏膜受损，使舌头根部出现充血、水肿，可形成痘痘状水疱，可在医生指导下使用阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等药物预防感染，并配合康复新液缓解烫伤。
2、舌乳头炎：指的是舌乳头部位出现炎症性病变，可分为丝状舌乳头炎、菌状乳头炎、叶状乳头炎、轮廓乳头炎等。炎性因子会阻碍舌头部位的血液循环，对舌头根部造成损伤，使舌头出现充血、水肿等现象，可能会出现红色凸起的痘痘，可在医生指导下使用头孢克肟分散片、阿奇霉素分散片等药物进行治疗。
3、口腔溃疡：咬伤、微量元素缺乏等因素导致口腔溃疡时，可能会损伤舌头根部黏膜，导致局部出现血肿，表现为红色、凸起的痘痘，并伴有疼痛等症状，吞咽时疼痛加剧，可以遵医嘱使用口腔溃疡散、口腔溃疡含片等药物进行治疗。
4、口腔尖锐湿疣：由于感染HPV引起的一种口腔疾病，HPV会对人体的皮肤、黏膜等造成损伤，从而使人体皮肤、黏膜出现过度增生，累及到口腔部位时可能会出现口腔尖锐湿疣，导致舌根部有红色、凸起的痘痘。可在医生指导下通过激光、冷冻、电灼、手术切除等方式治疗，还可使用利巴韦林片、阿昔洛韦片等抗病毒药物。
5、舌根部淋巴滤泡增生：舌根部位有淋巴组织，舌根部淋巴滤泡增生是淋巴组织对炎症的一种保护性反应，舌根部出现淋巴滤泡增生时可表现为充血、红肿的现象。可在医生指导下使用头孢克肟分散片、利巴韦林片等药物治疗，如果增生情况比较严重，可通过激光手术、消融手术等方式治疗。
6、咽喉炎：感染细菌、病毒等病原体引起咽喉炎时，可能会对喉部黏膜造成损伤，从而造成咽喉部黏膜充血、发炎。舌头根部在咽喉附近，当咽喉部黏膜充血发炎的情况严重时，可能会累及到舌根部，导致舌头根部充血、红肿、出现小痘痘，可在医生指导下使用阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等药物进行治疗。
7、舌头疱疹：感染水痘-带状疱疹病毒、单纯性疱疹病毒等疱疹病毒，可能会出现舌头疱疹，疱疹病毒会对舌黏膜造成损伤，病变累及舌根部时，可导致舌根部出现红色凸起状的水疱，可在医生指导下使用利巴韦林片、阿昔洛韦片等药物进行治疗。
舌头根部有红色、凸起的痘痘时，建议患者及时到医院口腔科就诊，通过分泌物培养等检查查找病因，遵医嘱进行相应处理。