感染毛滴虫通常不会自愈，长时间不进行治疗，还会使感染持续加重，可能会影响女性生育能力，建议患者要及时就医，配合医生进行治疗。
毛滴虫感染常见于没有做好个人防护，存在不洁性行为、与他人共用私人物品等情况。感染初期可能症状比较轻微，不及时治疗也不会自愈。有的患者如果不及时治疗，病情还会加重，可出现瘙痒、刺痛、分泌物异常等症状，还可能会诱发子宫内膜炎、盆腔炎等疾病，将会影响女性生育能力，也会对精子造成杀灭的作用，影响男性生育能力。因此，如果怀疑有毛滴虫感染，要及时就医完善视诊、分泌物显微镜检查、毛滴虫培养检查等项目确诊。
确诊后需要在医生指导下使用甲硝唑片、替硝唑片、奥硝唑胶囊等药物进行治疗。注意需要男女双方同时接受治疗，在治疗期间也要禁止性生活，并且注意下体卫生，防止交叉感染。并且及时更换干净的内衣、内裤，所有的内裤或者床单都要经过烫洗或者暴晒。