二硫化硒洗剂的副作用一般不会导致脱发，二硫化硒洗剂具有抗皮脂溢出和抗真菌的作用，通常用于治疗脂溢性皮炎、花斑癣等疾病引起的头皮脱屑和瘙痒等症状。如果用药期间出现脱发的情况，要考虑是否为脂溢性皮炎、花斑癣疾病刺激头皮部位毛囊引起，通常并不是药物导致。
二硫化硒洗剂主要成分是二硫化硒，还含有二氧化钛、甘油、皂土、枸橼酸、十二烷基二甲基乙酸酯、十八醇等化学物质。如果对此药成分过敏，用药后可能会刺激头皮，引起局部红肿、烧灼、疼痛、瘙痒等，还有可能出现丘疹、水疱等皮损。少部分患者还有可能出现头皮、头发干燥甚至脱色等副作用，但通常没有脱发的副作用。
二硫化硒洗剂在日常使用时要避免接触眼睛、口或鼻等黏膜部位，也不能接触皮肤糜烂、渗出部位。在染发、烫发后两天内不能使用此药，而且使用后应将药物冲洗干净，以免增加药物不良反应发生的风险。如果用药后头皮有明显灼烧感、疼痛感，建议及时用清水清洗残留药液，然后到医院皮肤科就诊，考虑更换其他药物治疗。