如果孕妇在怀孕期间出现抗甲状腺过氧化物酶抗体升高，但是甲状腺功能正常，一般不需要进行特殊治疗，但如果是甲状腺功能亢进症、甲状腺功能减退症、甲状腺炎、系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等原因导致的抗甲状腺过氧化物酶抗体升高，则需要在医生指导下根据具体原因进行治疗。
1、甲状腺功能亢进症：是由甲状腺本身引起的血液循环中甲状腺激素过多，进而导致人体神经、循环、消化等各系统兴奋性增高和代谢亢进，由于甲状腺激素分泌过多，进而导致孕妇抗甲状腺过氧化物酶抗体高，患者可在医生指导下使用药物进行治疗，常用的药物有丙硫氧嘧啶片、甲巯咪唑片等，患者还可以在妊娠中期进行手术治疗，比如双甲状腺次全切除等。
2、甲状腺功能减退症：是由于甲状腺激素绝对或相对不足导致，抗甲状腺过氧化物酶抗体与甲状腺素的合成有关，甲状腺功能减退症可导致甲状腺抗体对自身甲状腺细胞组织产生抗体反应，导致过氧化物酶抗体偏高，早期一般没有明显症状，部分患者可能会出现畏寒、食欲减退、乏力等症状。孕妇可在医生指导下应用左甲状腺素钠片治疗，可补充甲状腺激素，也可以在日常生活中多吃一些含碘高的食物，比如紫菜、海带等。
3、甲状腺炎：是自身免疫、病毒感染、细菌感染引起，由于甲状腺滤泡破坏可导致孕妇抗甲状腺过氧化物酶抗体高，患者可在医生指导下使用甲状腺片、盐酸普萘洛尔片等药物进行治疗。
4、系统性红斑狼疮：是一种由致病性自身抗体和免疫复合物介导器官、组织损伤的自身免疫病，由于自身性免疫损伤，导致甲状腺抗体对自身甲状腺细胞组织产生抗体反应，使孕妇的过氧化物酶抗体偏高，患者可在医生指导下使用布洛芬缓释胶囊、阿司匹林片、泼尼松龙片、甲泼尼龙片等药物进行治疗。
5、类风湿关节炎：是一种常见的慢性、全身性自身免疫性疾病，由于自身性免疫损伤，也有可能导致怀孕期间抗甲状腺过氧化物酶抗体升高，患者可在医生的指导下使用双氯芬酸钠片、洛索洛芬钠片等药物进行治疗，平时需要注意保暖。
如果孕妇在怀孕期间出现抗甲状腺过氧化物酶抗体升高的现象，应立即去医院的内分泌科就诊，通过甲状腺功能检查诊断，同时还要进行B超检查了解胎儿的发育情况。