地衣芽孢杆菌活菌胶囊通常饭前吃或饭后吃都可以，并没有严格的要求，患者可根据自身饮食习惯，选择合适的时间进行服用。
地衣芽孢杆菌活菌胶囊是一种调节肠道菌群的药物，主要成分为大量的益生菌，可用于治疗急、慢性肠炎，以及肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀等不适。此药物刺激性较小，一般可选择在饭前吃，并不会刺激到胃肠道黏膜，能起到较好的药物疗效，若自身胃肠道较为虚弱，对药物较为敏感，此时则可选择饭后再吃，以降低对机体的刺激，并且也不会影响药效。而且该药物需避免与抗菌药同服，若患者需要服用抗菌药，建议间隔2-3小时。通常患者在服用地衣芽孢杆菌活菌胶囊时，需要首次加倍，若存在吞咽困难的症状，则可以在服用时打开胶囊，将药粉加入少量温水中混合后服用。但需注意溶入水的温度不宜过高，以免将药物中的活菌杀灭，促使药效降低。
对于部分人群来讲，在应用此药物后，可能会出现便秘等不良反应，日常建议多吃一些纤维素含量高的食物，如香蕉、芹菜等。若便秘情况比较严重，则需要及时停止使用药物，改用其他药物进行治疗。另外服用此药物时，一定要遵医嘱根据自身的病情，服用对应药物的剂量，不可私自增加或减少药物剂量，以免影响病情恢复。