湿热灭菌和干热灭菌相比较，湿热灭菌存在优势。两者都属于热力灭菌和消毒的方式，存在原理不同、方法不同的区别，另外，其适用范围和作用温度也存在不同。
1、原理不同：干热灭菌是在干燥的环境下，用高温杀死细菌和细菌的芽孢，而湿热灭菌是利用饱和水蒸气或沸水进行灭菌的方法。
2、方法不同：干热灭菌主要分为火焰灭菌法、干热空气灭菌法，而湿热灭菌主要分为热压灭菌法、流通蒸气灭菌法与煮沸灭菌法、煮沸灭菌和低温间歇灭菌等。
3、适用范围不同：干热灭菌适用于干燥粉末、玻璃器皿和金属器具的灭菌，而湿热灭菌适用于药物制剂生产过程中的灭菌。
4、作用温度不同：干热灭菌的温度应不低于150℃，作用时间30分钟以上，而湿热灭菌主要在60-100℃之间。
由于湿热灭菌时蒸气的比热大，穿透力强，容易使蛋白质凝固或变性，最终导致微生物的死亡。所以该方法的灭菌性比干热灭菌强，具有灭菌效果可靠、操作简单方便的特点，也是目前制剂生产中应用最广泛的一种灭菌方法。