阴茎发育缓慢通常是由于营养不良所致，包茎和包皮过长也可能会引起。少数情况下，可能是激素不足或者先天畸形所致。
1.营养不良：如果存在长期挑食、偏食的不良饮食习惯，可能会导致身体营养不良，从而出现阴茎发育缓慢的情况。建议及时调整饮食，多进食富含营养的食物，如牛奶、鸡蛋、牛肉等。
2.包茎：是指包皮外口过小，紧箍阴茎头部，不能向上外翻，此时会影响阴茎的正常发育，建议在医生的评估下进行手术治疗改善。
3.包皮过长：是指包皮不能使阴茎头外露，但可以翻转，单纯的包皮过长，可能不会导致阴茎发育缓慢，发展成包茎的时候才可能会影响发育，此时可以在医生的评估下进行手术治疗。
4.激素不足：如果男孩雄激素分泌不足，会导致第二性征发育迟缓，此时可配合医生使用雄性激素治疗，例如丙酸睾酮注射液、十一酸睾酮软胶囊等，以促进发育。
5.先天畸形：如果男生存在先天外生殖器发育异常，就可能表现为小阴茎的情况，此时也可采用雄性激素补充治疗，例如遵医嘱使用十一酸睾酮注射液、丙酸睾酮注射液等。
如果在青春期发现男孩阴茎发育缓慢，建议积极到医院的泌尿外科、儿科等科室就诊，由医生进行视诊、激素测定等，判断具体原因。