阴道囊肿手术的费用根据医院等级、经济发展水平，以及手术的复杂程度的不同，而有所不同，一般需要1000-6000元，但是具体价格建议咨询医院医生。
阴道囊肿手术是一种常见的妇科手术，然而，手术的费用并不是固定的，医院等级是影响手术费用的一个重要因素。一般来说，三甲医院的手术费用会比较高，因为这些医院通常拥有先进的医疗设备，而二级或一级医院的手术费用会相对较低。
经济发展水平也会影响手术的费用，在经济发展较好的地区，医疗费用通常也会相应提高。另外，阴道囊肿的大小、位置、数量等，都会影响手术的难易程度。如果阴道囊肿较大、位置较深，或者数量较多，手术更复杂，费用也会相应提高，可能在6000元左右。
相反，如果阴道囊肿较小、位置较浅，手术就会相对简单，费用也会相对较低，可能在1000元左右。
阴道囊肿手术是用阴道拉钩暴露阴道囊肿位置，以鼠齿钳钳夹固定覆盖在肿瘤的阴道黏膜，于其外端表面纵向切开，切开阴道黏膜贯穿囊肿，之后剥离囊肿，整个手术的过程较快、安全性高，患者不需要太担心。