褪黑素多数不能与非甾体抗炎药、感冒药物、麻醉镇痛药、抗血小板凝聚药物、胃肠道用药、胰岛素类药物等一起吃，有可能会对药性的发挥造成不良影响，不利于自身睡眠质量的提高和改善。
1、非甾体抗炎药：如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片、塞来昔布胶囊等，褪黑素可起到提高睡眠质量的作用，但与非甾体抗炎药一起吃，有可能会对褪黑激素分泌造成影响，不利于改善睡眠。
2、感冒药物：如复方氨酚烷胺片、复方氨酚烷胺胶囊等，通常不能与褪黑素一起使用，因为感冒药物里面通常含有消炎的成分，这些成分容易与褪黑素发生拮抗反应。
3、麻醉镇痛药：如盐酸曲马多缓释片、盐酸曲马多注射液等，因为麻醉镇痛药可起到镇静止痛的作用，而褪黑素也有一定的镇静效果，药物共同使用很可能会产生重叠效应，容易导致患者出现昏睡症状。
4、抗血小板凝聚药物：如阿司匹林肠溶片、硫酸氢氯吡格雷片、替格瑞洛片等，抗血小板凝聚药物使用期间通常可以抑制体内的血小板生成，与褪黑素药物共同使用药性并不相同，可能会加速褪黑素分解，不利于睡眠调理和治疗，容易影响治疗效果，并不能够在一起吃。
5、胃肠道用药：如奥美拉唑肠溶胶囊、多潘立酮片、胶体果胶铋胶囊、蒙脱石散等，因为胃肠道药物与褪黑素药物共同使用，可能会加重胃肠道负担，容易影响胃肠道功能，并不利于身体健康。
6、胰岛素类药物：如地特胰岛素注射液、低精蛋白锌胰岛素注射液、门冬胰岛素注射液等，胰岛素类药物与褪黑素共同使用后，可能会使患者出现睡眠中低血糖的不良后果，容易导致患者无法及时识别低血糖，还可能会导致低血糖的程度加重或延误病情治疗，从而不利于身心健康。
如果使用褪黑素期间患者出现任何不适，建议及时到急诊科就诊，完善血常规检查以判断具体情况，从而在医生指导下进行对症治疗。另外患者在使用褪黑素期间应严格按照规定进行服用，避免自行增减药量，以免影响药效，对身体健康会造成不良影响。