指甲下面长一层软肉垫，可能是非疾病因素导致，也可能是甲沟炎、甲癣、甲下疣等疾病因素引起，建议在医生的指导下针对性治疗。
一、非疾病因素：
如果平常修剪的指甲过短，或者撕扯甲周的倒刺，就有可能形成下面长一层软肉垫。还可能与使用肥皂等碱性洗涤剂等有关，导致角质层干燥，出现指甲下长肉的情况，以上情况一般不需要治疗，改变生活习惯、做好手部防护，会逐渐改善。
二、疾病因素：
1、甲沟炎：一般是由于指甲出现外伤，细菌通过甲旁皮肤的破损，进入皮下造成感染引起，导致指甲周围出现炎症反应，炎症因子浸润局部，刺激周围组织出现疼痛、肿胀、局部发红、化脓等情况，导致局部出现异常增生。患者可遵医嘱使用夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏等药物进行局部涂抹，可能也要服用阿莫西林胶囊，头孢克肟分散片等抗菌药物进行治疗。
2、甲癣：主要是受到皮肤癣菌感染引起，也有可能是不注意局部卫生引起，病原菌刺激局部致使出现甲板变色、萎缩等情况，从而导致指甲下面长软肉垫，伴有指甲颜色改变、指甲变脆等症状。患者可遵医嘱服用伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等药物进行治疗，也可通过拔甲或病甲清除术、激光治疗等手术治疗。
3、甲下疣：主要是人乳头瘤病毒感染引起的，甲下疣会导致指甲周围增生，在皮肤浅表的良性赘生物，皮肤颜色可能是褐色，可能会有疼痛症状，可以通过激光或者冷冻治疗。
另外，指甲下面长一层软肉垫还可能与甲反向胬肉有关，建议去医院皮肤科就诊，通过视诊、真菌镜检、触诊等相关检查，明确病情，积极配合医生治疗。日常生活中，注意局部的卫生清洁，避免受到继发性感染。