口腔囊肿的分类不同，其形成的原因不同，但通常与创伤、结构异常等因素导致渗出液发生阻塞，引起周围不适有关。
1、唾液腺黏液囊肿：可分为外渗性黏液囊肿及潴留性黏液囊肿，前者是由创伤引起的黏液性肉芽肿，后者是导管系统的阻塞所致，通常可观察到内容物，也可发生反复的破裂；
2、口腔颌面部囊肿：可分为软组织囊肿和颌骨囊肿，其中前者与皮脂腺排泄管阻塞，内容物潴留等因素有关，后者为炎性刺激引起的组织液不断渗出、增生、胚胎发育过程中残留物增加等因素导致，可出现硬肿或渗出。
口腔囊肿患者通常因口腔异物而前往医院就医，医生一般可根据患者的病史及临床表现，结合X线检查等明确诊断，通常需要采取手术切除，防止囊肿扩大、症状加重。