小柴胡颗粒可以和藿香正气胶囊一起吃，这两种药物并没有明确的配伍禁忌。同时患者在使用药物时一定要在医生指导下进行，避免盲目应用。
小柴胡颗粒是由柴胡、黄芩、姜半夏、党参、生姜、甘草、大枣等成分构成，是一种黄色至棕褐色的颗粒，具有解表散热、疏肝和胃的作用，可以用于治疗外感病、邪犯少阳证，症见寒热往来、胸胁苦满、食欲不振、心烦喜呕、口苦咽干的症状。需要注意的是此药物风寒感冒者一般不适用，对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用。
藿香正气胶囊是由广藿香、紫苏叶、白芷、白术、陈皮、法半夏、厚朴、茯苓、桔梗、甘草、大腹皮、大枣、生姜等成分构成，具有解表化湿、理气和中的作用，可以用于治疗外感风寒、内伤湿滞、头痛昏重、胸隔痞闷、脘腹胀痛、呕吐泄泻的症状。此药物在服药期间不宜同时服用滋补性中成药，并且服药3天后若症状未改善，或出现吐泻明显的现象，则应去医院就诊。这两种药物之间并没有药物相互作用，也不存在药物冲突，如果患者对证则可以在医生的指导下一起吃，或间隔30分钟左右服用。
若患者在使用上述药物 后出现了胃肠不适等现象，建议及时就诊于内科，通过完善血常规、血生化、尿常规等明确诊断再进行相应治疗。