正常使用艾草贴肚脐没有危害，但若是使用不当，则可能对人体造成一定危害，如过敏、感染、加重原有症状等，建议患者在医生指导下进行贴敷。艾草贴肚脐在使用时不需要点燃，直接贴敷即可，属于中医脐灸的范畴，肚脐是神阙穴所在的位置，其下具有丰富的毛细血管网，有利于药物的充分吸收，因此是进行药物贴敷的重要部位。
1、过敏：因为艾叶挥发油对皮肤有轻度刺激作用，所以过敏体质的人群，以及对艾草过敏的患者，在接触艾草后可能会出现过敏反应，导致局部皮肤出疹、红肿、疼痛，进而引起全身症状，如发热、呼吸困难、喉头水肿等，甚至危及患者的生命安全。
2、感染：如果肚脐附近皮肤存在伤口，使用艾草贴肚脐，可能造成艾草内的杂质通过伤口进入皮肤，引起局部皮肤感染，出现发红、发热、疼痛等症状。
3、加重原有症状：由于艾草性温，内热较盛的人群如果再使用艾草贴肚脐，则易加重原有的口干、小便黄等临床症状。若是对于经常出现睡眠中流汗、手心脚心流汗、失眠等症状的阴血不足的人群，艾草贴肚脐可能会加重阴血亏虚、失眠等症状。
4、其他：由于艾草贴肚脐具有温经通络、活血的作用，孕妇在怀孕期间禁用此功效的药物，如果贸然使用可能会出现子宫出血及流产等的情况。
中医讲究辨证论治，艾草贴肚脐对人体是否有危害也需要结合患者自身的情况来进行判断，建议患者前往中医科门诊，通过望诊、闻诊、问诊、切诊进行四诊合参，在专业医生的指导下正确使用，切不可自行贴敷，以免影响身体健康。