霍乱和疟疾都属于传染病，但是病因不同、症状不同、传播途径不同、治疗药物不同。高危易感人群可通过注射疫苗进行预防，可降低得病的几率，但只有霍乱有疫苗。
1、病因不同：霍乱是由01群或0139群霍乱弧菌引起的甲类传染病，疟疾是由于感染疟原虫引起的虫媒传染病，属于乙类传染病。
2、症状不同：霍乱患者的主要症状为腹泻、呕吐和排米泔样便。疟疾患者通常为周期性发作，可出现发热、出汗、寒战等。
3、传播途径不同：霍乱的传播途径是喝被污染的水源，吃被霍乱弧菌污染的水果，蔬菜以及谷物等，或者接触感染者的排泄物等。疟疾的传播途径是蚊虫叮咬，与疟疾患者共用注射针头，输入带有疟原虫的血液以及通过母婴传播。
4、治疗药物不同：霍乱患者可在医生指导下服用诺氟沙星胶囊或盐酸环丙沙星片等抗菌药物进行治疗，能够杀灭霍乱弧菌，有助于疾病的治疗。疟疾患者可在医生指导下服用磷酸伯氨喹片，以及磷酸氯喹片、双氢青蒿素哌喹片等药物，或是静脉输注磷酸咯萘啶注射液、注射用青蒿琥酯等药物治疗。
如果患者存在腹泻、寒战等症状时，怀疑是霍乱或疟疾，需到医院的 传染科就诊，通过血常规检查、血液涂片染色检测、大便常规检查等明确诊断。患者在治疗期间应注意休息，保证充足的睡眠，有助于机体恢复。