胆总管结石患者需根据个人具体情况选择治疗方式，通常没有最佳的治疗方法，常用方式包括药物治疗、内镜治疗、外科手术等，必要时可采取综合治疗方案。
1、药物治疗：胆总管结石的患者可遵医嘱用药治疗，如熊去氧胆酸片、复方胆通片等利胆药，以预防或缓解症状。存在感染者需积极进行抗感染治疗，如头孢克肟分散片、头孢克洛胶囊等抗生素，也可根据药敏试验、细菌培养等检查结果选择药物。疼痛剧烈难以忍受者，可使用消旋山莨菪碱片、颠茄片等解痉药物，以缓解痉挛、减轻疼痛。此外，用药过程中可补充葡萄糖，以进行营养支持治疗，确保更好的治疗效果。
2、内镜治疗：主要通过口腔、食道和十二指肠进行治疗，根据患者有无合并胆管炎采取相应措施。若无胆管炎，但经检查发现结石直径1-1.5cm、不适合胆囊切除等人群，可采取内镜下乳头括约肌切开取石术。胆总管结石合并有急性胆管炎患者，可择期进行内镜下治疗，无法进行内镜下乳头肌切开取石术的人群，可以选择鼻胆管引流术，待病情稳定后再进行胆囊切除术。内镜治疗期间，可在医生指导下使用盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等药物，以预防感染。
3、外科手术：胆总管结石患者可通过外科手术将结石取出，解除胆管现有的梗阻、狭窄状态，需保证手术后引流通畅。术后可在医生指导下进行体育锻炼，选择较为缓和的运动方式，如散步、太极拳等，以改善机体血液循环，促进机体恢复。
胆总管结石患者经治疗后需定期到医院复查，以观察治疗效果。治疗期间要做好日常护理，少吃辛辣刺激性食物、不吃高脂肪食品、避免吸烟和饮酒，不要暴饮暴食，以免胆总管结石复发。