月经第六天有褐色分泌物，可能是正常现象，即非疾病因素导致，一般不需要处理，还可能是子宫颈息肉、感染性疾病等疾病因素所致，此时需要对症处理。
一、非疾病因素：
1、积血：个人体质不同，所以月经时间长短也不同，通常情况下月经结束时间是3-7天，如果患者月经的第六天有褐色分泌物，可能还处于月经期，少量子宫内膜剥落还积存在阴道，在阴道中氧化，可表现为褐色分泌物，一般无需进行特殊处理。
2、过度同房：在月经第六天时患者发生性行为，由于过度同房，动作过于剧烈，可造成阴道黏膜破裂、出血，被氧化后出现褐色分泌物，一般无需处理，会自行愈合，但是月经期间不建议同房，否则容易造成感染。
二、疾病因素：
1、子宫颈息肉：一般是长期炎症刺激导致子宫颈局部增生，可能引起子宫颈息肉，由于外界刺激可能导致子宫颈息肉破裂出血，出现阴道不规则出血，由于血液在阴道时间较长，可能会出现月经第六天出现褐色分泌物的情况，与月经没有直接关系。建议在月经结束后，经医生指导，采取子宫颈息肉摘除术、子宫颈锥切术等方法进行治疗。
2、感染性疾病：一般是患者不注意局部卫生，出现阴道与尿道等部位感染所致，如盆腔炎、阴道炎、子宫颈炎等，由于炎症刺激导致阴道黏膜比较脆弱，容易引起破裂、出血，患者可能会出现月经第六天阴道褐色分泌物的情况，与月经没有直接的关系。这时建议在医生的指导下使用头孢克肟分散片、克霉唑片、伊曲康唑胶囊等药物进行治疗。
3、其他疾病：如子宫颈癌、子宫内膜癌、阴道癌、外阴癌等，由于癌细胞刺激，会导致阴道有少许血性分泌物，正好在月经第六天排出时，表现为月经第六天存在褐色分泌物。建议遵医嘱及时进行手术切除，后续可根据病理结果采取化疗、放疗等治疗。
患者出现月经期第六天有褐色分泌物时，可以到医院妇科就诊，采取血常规等检查明确是否伴有感染，先排除非疾病因素后遵医嘱治疗，不建议自行用药，在遵医嘱用药期间也不建议食用辛辣、刺激性食物，防止影响药物疗效。