甲氧基肉桂酸乙基己酯对皮肤的主要作用就是防晒，且防晒效果较好，对皮肤刺激较小；还具有抑制空气沉降菌生长的作用，包括各种细菌、真菌。
1、防晒：甲氧基肉桂酸乙基己酯又名甲氧基肉桂酸辛酯，是医药中间体，是常见的油溶性UVB防晒剂添加物。它也可以溶于乙醇，能有效防止280-310nm的紫外线，且吸收率高，可用于隔离霜、粉底液、防晒霜等化妆品中。
2、抑制空气沉降菌生长：甲氧基肉桂酸乙基己酯能够广泛抑制空气中悬浮的多种细菌、真菌，但是这类物质的抗菌作用不如激素、抗生素效果，故虽然可用于药物制成，但相对少见，临床使用也需要严格遵医嘱进行，尚无相关药物安全性研究数据，需要谨慎应用。
因甲氧基肉桂酸乙基己酯属于渗透促进剂，易被皮肤吸收，会产生类似雌激素的效果，故不推荐孕妇及儿童使用。并且这种物质临床研究尚表浅，安全性有待确定，故皮肤过敏者不推荐使用。如使用过程中出现皮肤瘙痒、发红等过敏症状，应及时清洗并就医。