滴虫性龟头炎和念珠菌龟头炎都属于包皮龟头炎，滴虫性龟头炎和念珠菌龟头炎的主要区别在于发病原因不同、表现症状不同，以及治疗方法不同，若出现其中一种疾病，建议及时去医院就诊。
1、发病原因不同：滴虫性龟头炎主要是由于患者感染阴道毛滴虫所致。念珠菌性龟头炎主要是由于患者感染念珠菌所致。
2、表现症状不同：滴虫性龟头炎患者可能会出现尿道炎，但也有部分患者不会出现尿道炎，在发病早期会出现龟头部起丘疹、红斑，随着病情不断发展，范围逐渐扩大，红斑上可能会出现针头大至粟粒大的小水疱，随着水疱不断扩大，互相融合，可能会出现轻度糜烂面，并且在分泌物中可找到滴虫。念珠菌性龟头炎患者主要表现为包皮内侧、冠状沟、龟头出现轻度潮红、针头大小淡红色丘疹或薄壁小脓疱，表浅糜烂或附有白色奶酪样物质，若致病菌侵犯阴茎及阴囊，可能会导致患者出现鳞屑性红斑。
3、治疗方法不同：滴虫性龟头炎患者可在医生的指导下口服甲硝唑片进行治疗，也可以在局部使用甲硝唑洗液进行冲洗治疗。念珠菌龟头炎患者可在医生指导下使用抗真菌药物进行治疗，可以局部使用克霉唑乳膏、曲安奈德益康唑乳膏等药物治疗，若是由包皮过长所导致的疾病，还可遵医嘱进行手术治疗，比如包皮环切术。
滴虫性龟头炎和念珠菌龟头炎患者应及时到医院泌尿外科等科室进行就医，确诊后在医生指导下进行治疗，在治疗期间以及日常生活中，要保持局部皮肤的清洁和干燥，以免发生感染，治疗期间应避免进行性生活。