连花清瘟胶囊是否治疗咳嗽，需要根据咳嗽的原因决定，并不可以盲目判断。如果是热邪导致的咳嗽，通常可以起到治疗作用，如果是寒邪导致的咳嗽，通常并不能起到治疗的效果。
1、热邪：连花清瘟胶囊的主要成分是金银花、连翘、炒苦杏仁等，同时也包含了红景天、大黄、薄荷脑等，具有宣肺泄热、清热解毒的作用，可以用于热毒犯肺导致的流行性感冒，此类患者通常会有咳嗽、发热、咽痛等症状。对于这种情况，患者可以在医生指导下使用连花清瘟胶囊，可以治疗咳嗽。
2、寒邪：引起咳嗽的原因有多种，除了热毒犯肺，也有可能是因为寒邪犯肺导致，可见于风寒感冒，连花清瘟胶囊是清肺热的药物，性质寒凉，此时服用，不仅起不到治疗效果，还可能会导致症状加重。
出现咳嗽的症状以后，建议患者及时到医院的中医科就诊，在医生辨证论治后，明确导致此类情况的原因，并选择合适的药物进行治疗，使病情得到有效控制。患者不可以盲目用药，否则可能会出现药不对症的情况，不仅会影响到疾病的治疗，还可能会加重病情。