肠镜检查正常表现为局部肠道黏膜完整、无溃疡、息肉，且黏膜内壁光滑，并呈粉白色。如十二指肠肠镜检查正常可看到十二指肠球腔呈球形，黏膜光整无皱襞，黏膜色较胃黏膜略淡或呈暗红色，黏膜因由高柱状微绒毛组成呈天鹅绒样外观。

做肠镜检查有一些禁忌症：肠道未准备好，不够清洁，影响观察和插入者；严重的心肺功能不全，不能承受检查前清洁肠道准备的检查者；妊娠、高热、身体极度衰弱者；急性腹泻、严重溃疡性结肠炎、结肠克罗恩病等。