窦房结是心脏中自律性最高的组织，正常情况下，窦房结的自律性控制着心脏的搏动，在心电图上产生P波。正常窦性心律为窦性P波规律出现、P波频率为60-100次/分、PP间期之差＜0.12秒。窦性心律不齐在心电图上表现为窦性心律周期长短不一，同一导联最长PP间期减去最短PP间期之差＞0.12秒。

窦性心律不齐常与窦性心动过缓同时存在，较常见的一类心律不齐与呼吸周期有关，称呼吸性窦性心律不齐，多见于青少年，一般无临床意义。另有一些比较少见的窦性心律不齐与呼吸无关，例如与心室收缩排血有关的（室相性）窦性心律不齐以及窦房结内游走性心律不齐等。