常用的肠道吻合器械包括直线型切割吻合器及圆形吻合器，结构设计及适用范围各不相同。

• 圆形吻合器：圆形吻合器能够形成两圈环形的钉合，同时切断环内的组织，常用于内脏的端–端吻合或端–侧吻合。吻合器的柄设计有直线型或者弧形，其前面的抵钉座也可以有可拆卸型或者可倾倒型，以适用于不同的组织脏器，尤其适用于低位直肠的切除吻合、切断食管或行经腹的食管–空肠吻合等不同情况。根据吻合直径不同，分为不同规格，适用于21-33mm不同直径的肠道管腔的吻合；



• 直线型切割吻合器：也叫直线切割闭合器，有四排相互平行的钉子，中间则是一个刀片。使用的时候，四排钉子先钉合组织，然后再激发刀片进行切割。直线切割吻合器的长度从50-90mm分为不同的规格，能够进行侧–侧吻合或残端的闭合。在一次使用后，钉舱可以重新更换而再次使用。此外，直线切割闭合器还可以通过腹腔镜的腹壁10mm刺孔而进行肠道的吻合。

与手工吻合相比，吻合器优势在于安全，污染机会减少，创伤小，减少了肠内容物的漏出。此外，在一些吻合中(如末端直肠与结肠的吻合)，由于吻合器的使用，使得一些传统手工缝合很难完成的操作变得更为简便快速，而且更加可靠。但有些吻合则更加适合手工缝合完成(如胆肠吻合和胰肠吻合)。