正常情况下，在正规医院由专业的医生艾灸关元穴，不会有什么危害，反而可以促进气血流通，增强体质。但如果自行盲目艾灸关元穴，可能会导致出现腹部受凉、过敏的现象，还可能会出现烫伤、热伤，甚至是感染等危害。
1、腹部受凉
关元穴位于脐下，进行艾灸时需将局部衣物掀开，暴露皮肤。如果艾灸的环境温度较低，可能导致腹部受凉，对腹部产生一定寒凉刺激，引起腹痛或腹泻等不适。
2、过敏
艾灸指的是利用点燃的艾绒所产生的热力和药物的作用，通过对腧穴部位进行温熨，达到防治疾病的方法。如果患者对艾绒存在过敏的情况，进行艾灸后可能会导致出现过敏反应，表现为艾灸部位出现皮疹、瘙痒。
3、烫伤
如果自行盲目艾灸关元穴，由于操作不当，导致局部皮肤过度接触热艾烟或过热的灸具，可能会导致出现烫伤的情况。
4、热伤
如果患者存在实热证或体内本身存在热毒，如果此时艾灸关元穴，可能会导致体内的实火更加旺盛、症状加重，出现热伤。
5、感染
如果患者使用了不洁的灸具，可能会导致皮肤灸痕部位出现细菌感染，出现疼痛、发热、溃烂等症状。
除此之外，还可能会有晕灸等危害。因此，如果患者需要进行艾灸，在艾灸治疗之前建议咨询专业的医生，由专业医生进行规范的艾灸操作，从而减轻操作不当引起症状加重的可能性，并尽量消除患者的紧张情绪。