阴茎短小的治疗方法，主要包括心理治疗、内分泌治疗等非手术治疗和相关的手术治疗，如阴茎延长术、阴茎增粗术等。
1、非手术治疗
- 心理治疗：许多所谓的“阴茎短小”是心理因素导致的错觉。对于这种情况，心理治疗非常重要。心理医生会通过沟通和引导，帮助患者正确认识自己的身体，消除因阴茎短小产生的焦虑、自卑情绪。同时性伴侣的支持也很关键，双方可以一起参与性心理咨询，改善彼此间的沟通和性观念。
- 内分泌治疗：对于因内分泌失调引起阴茎短小的患者，如睾酮水平低下，可以采用内分泌治疗。一般会使用睾酮补充疗法，通过口服、肌肉注射或皮肤贴剂等方式补充睾酮。这种治疗可以促进阴茎二次发育，尤其适用于青春期发育迟缓导致阴茎短小的患者。
- 物理治疗：真空勃起装置也可以作为一种辅助治疗方法，它通过在阴茎周围产生负压，将血液吸引到阴茎海绵体内，使阴茎暂时增大。这种装置可以配合按摩等手法，促进阴茎的血液循环，在一定程度上改善阴茎的营养供应，可能对阴茎生长有一定的帮助，但效果通常比较有限。
2、手术治疗
- 龙氏阴茎延长术：手术过程中，医生会小心地分离和处理相关组织，避免损伤血管和神经。术后阴茎在疲软状态下可以延长一定长度，但勃起功能一般不受影响。
- 阴茎增粗术：对于希望增粗阴茎的患者，可以采用阴茎增粗术。常见的方法有自体脂肪移植和生物材料填充、玻尿酸增粗。自体脂肪移植是将自身其他部位（如腹部、臀部）的脂肪抽取出来，经过处理后注射到阴茎海绵体周围，达到增粗的效果。生物材料填充则是使用一些安全的人工材料，如硅胶等，植入阴茎皮下，增加阴茎的周径。
同时，患者要对治疗效果有合理的预期，并且在治疗过程中要积极配合医生，注意可能出现的风险和并发症。
阴茎短小患者治疗期间需要复查的项目
- 定期通过心理问卷或与心理医生面谈的方式复查，如采用症状自评量表（SCL-90）等工具，评估患者的焦虑、抑郁等情绪是否得到缓解。一般每1-2个月进行一次评估，观察患者对自身阴茎状况的认知是否更加合理，心理压力是否减轻。
- 也需要重点复查睾酮水平，包括总睾酮和游离睾酮。因为睾酮补充治疗需要维持在合适的水平，过高可能导致前列腺增生等问题，过低则达不到治疗效果。通常每3-6周进行一次血液检测，根据检测结果调整睾酮的补充剂量。
- 如果采用真空勃起装置等物理治疗，复查阴茎海绵体的血液循环情况。通过彩色多普勒超声检查（CDU），观察阴茎海绵体动脉的血流速度、血管内径等参数，了解物理治疗是否改善了阴茎的血液灌注。一般每3-6个月进行一次CDU检查。