滴眼药水时眼睛疼痛可能由多种原因引起，如滴用方法不正确、眼药水过期、角膜损伤等，需要根据具体原因进行处理。
1、滴用方法不正确：正确滴眼药水的方式应是一手扒开眼窝，一手挤压眼药水瓶，将药水滴注到球结膜囊内，避免直接滴到角膜上，因为角膜上神经较为敏感。调整滴眼药水的方法，确保药水正确滴入结膜囊内。
2、眼药水过期：超过眼药水的有限使用期，药水已经发生变质，再使用时会刺激眼睛引起疼痛等不适。检查眼药水是否过期，若已过期应立即丢弃并更换新的眼药水。
3、角膜损伤：频繁揉眼、划伤等导致眼角膜破损，滴眼药水时会刺激伤口处引发疼痛。避免揉眼和眼部外伤，如有角膜损伤应及时治疗，在角膜恢复期间可遵医嘱使用促进角膜修复的眼药水。
4、药物过敏：患者对眼药水中所含的某种成分过敏，滴用后对眼睛产生刺激，可有疼痛、视物模糊等表现。此时应立即停止使用该眼药水，并用生理盐水冲洗眼睛去除残留药液。
5、眼部炎症：如结膜炎、角膜炎等眼部炎症会导致病灶周围的感觉神经对痛觉反应过激，点眼药水时可能会感到明显的刺痛感。在医生指导下使用抗炎眼药水进行治疗，保持良好的眼部卫生习惯，避免感染加重。
如果疼痛严重或伴有其他不适症状，如红肿、流泪、视力下降等，应及时就医检查明确原因并接受相应治疗。