耳朵根疼可能是由多种原因引起的，如外耳道炎、中耳炎、腮腺炎等，还应及时查明原因，并选择合适的方法进行针对性治疗，改善症状。
1、外耳道炎：外耳道炎是外耳道皮肤或皮下组织的炎症，常由细菌感染引起，症状包括外耳道皮肤红肿、疼痛，严重时可能伴有脓性分泌物，耳朵根部的疼痛可能是外耳道炎的放射痛，需遵医嘱使用抗生素滴耳液或口服抗生素，保持外耳道清洁干燥。
2、中耳炎：中耳炎是中耳腔内的炎症，可由上呼吸道感染、咽鼓管功能障碍等引起，会导致中耳腔内压力增高，刺激鼓膜及周围组织，引起耳根部疼痛，需根据病情遵医嘱选择抗生素、滴耳液或手术治疗，注意休息，避免用力擤鼻。
3、腮腺炎：腮腺炎是由腮腺炎病毒引起的急性呼吸道传染病，主要表现为腮腺肿大、疼痛，腮腺位于耳垂下方，因此腮腺炎可能导致耳根部疼痛，治疗需遵医嘱采用抗病毒药物、对症治疗及预防并发症等措施。
4、智齿发炎：智齿生长位置不正或萌出异常时，容易引起智齿周围组织的炎症，即智齿冠周炎，炎症可能扩散至耳根部，引起疼痛，需先控制炎症，如遵医嘱口服抗生素、局部冲洗等，待炎症消退后考虑拔除智齿。
5、颞颌关节炎：颞颌关节炎是连接下颌骨与颞骨的关节炎症，位于耳根部，此疾病可引起头颈痛、咬合困难、颞下颌关节弹响等症状，严重时疼痛可放射至耳根部，需遵医嘱采用非甾体抗炎药、物理疗法或手术治疗，避免过度使用咀嚼肌。
患者在日常生活中应注意保持耳部清洁干燥，避免水进入耳道，避免用力擤鼻或挖耳，以免加重症状。患者饮食宜清淡，避免辛辣刺激性食物，注意休息，避免过度劳累。