百会穴在人体中的位置比较明确，位于头顶正中，是督脉的重要穴位，可以直接定位，也可以通过简便的方法确认。如果无法自行确认，可以到医院的中医科询问医生，得到准确的指导。
1、直接定位法：百会穴位于头顶正中线与两耳尖连线的交点处，正好位于头顶的最高点。
2、发际线定位法：从前发际线正中直上5寸处，也可以找到百会穴，可以根据每个人自己的手指宽度作为测量单位。
3、简便取穴法：可以取一条前后正中线，然后固定横轴，轴可以用两手拇指点按住两耳耳尖，中指做交接来固定，交点就是百会穴。
百会穴在中医中具有比较重要的地位，是各经脉气会聚之处，穴性属阳，又于阳中寓阴，能通达阴阳脉络，连贯周身经穴。常被用于治疗多种疾病，如头痛、眩晕、失眠、健忘、神经衰弱等，通过适当的按摩或针灸百会穴，可以提升人体的正气，推动气血运行，起到更好的治疗作用。
在对百会穴操作时，如按摩，可以取坐姿或站姿，放松身体，用双手的拇指指腹轻轻按压百会穴，力度适中，以局部有酸胀感为宜。若在按摩过程中出现头晕、恶心等不适症状，应立即停止并寻求专业医生帮助。
对于孕妇及月经期女性，需要避免过度刺激百会穴；若存在高血压、低血压等心脑血管疾病，在按摩百会穴时应谨慎，避免引起不适。