乳酸菌并非真菌，而是一类细菌，乳酸菌在生物学分类中属于细菌域、厚壁菌门、芽孢杆菌纲、乳杆菌目、乳杆菌科、乳杆菌属。在细胞结构方面，细菌和真菌有着本质区别。
- 乳酸菌作为细菌，其细胞具有典型的原核细胞结构。原核细胞没有真正的细胞核，遗传物质DNA分散在细胞质中，没有核膜包裹形成独立的细胞核结构。同时乳酸菌细胞具有细胞壁，其细胞壁主要成分是肽聚糖，这赋予了细胞一定的形状和强度。而真菌属于真核生物，其细胞具有完整的细胞核，核膜将遗传物质DNA与细胞质分隔开来。真菌细胞的细胞壁成分也与乳酸菌不同，主要由几丁质等物质构成。
- 从生长特性来讲，乳酸菌在适宜的环境下，繁殖速度相对较快，能够利用糖类等碳水化合物进行发酵代谢，产生乳酸等有机酸，这也是其得名的原因。在人体消化系统内，乳酸菌可以调节肠道微生态环境，能够通过竞争营养物质和黏附位点，抑制有害菌的生长，维持肠道内微生物群落的平衡，能够帮助人体消化食物，促进营养物质的吸收，特别是对于乳糖的消化。
- 一些人由于体内缺乏乳糖酶，无法有效消化牛奶中的乳糖，而乳酸菌可以将乳糖分解为葡萄糖和半乳糖，从而改善乳糖不耐受人群的消化状况。
此外，乳酸菌还能刺激肠道黏膜细胞的生长和修复，增强肠道屏障功能，防止有害物质透过肠道黏膜进入人体循环系统，对维护肠道健康和整体身体健康起着积极作用。而真菌在人体消化系统中，除了少数益生菌酵母等特定种类外，多数情况下，一些致病性真菌可能会引发疾病，如念珠菌感染可导致口腔、肠道等部位的炎症。
预防与乳酸菌相关潜在问题的方法
1、维护肠道微生态平衡：增加膳食纤维的摄入，多吃新鲜蔬菜、水果和全谷物等食物，这些食物能够为肠道内的有益菌提供营养，促进其生长繁殖。避免滥用抗生素，抗生素在杀死有害菌的同时，也可能会破坏肠道内的乳酸菌等有益菌，导致肠道微生态失衡。
2、关注身体反应：在摄入乳酸菌制品或补充乳酸菌制剂后，密切关注自身身体反应。如果出现腹胀、腹痛、腹泻等不适症状，可能是肠道对乳酸菌的适应出现问题，或者存在其他潜在的肠道疾病，建议及时就医。