纹眼线可能会对眼睛造成一定伤害，这种伤害体现在操作过程、术后恢复以及远期影响等多个方面。
在纹眼线的操作过程中，存在感染风险。纹眼线需要使用专业的纹刺针具在眼睑部位进行操作，若操作环境达不到严格的无菌标准，或者纹刺针具消毒不彻底，就容易使细菌、病毒等病原体入侵眼部。
一旦发生感染，轻者可能出现眼睑红肿、疼痛，重者可能引发结膜炎、角膜炎，导致眼睛畏光、流泪、分泌物增多，甚至影响视力。同时，操作时如果纹刺针具不小心损伤眼球表面组织，如角膜上皮，也会给眼睛带来直接的创伤。
术后恢复阶段同样存在隐患，纹眼线使用的色料多为化学物质，部分人的眼部皮肤可能对这些色料产生过敏反应。过敏症状可能表现为眼睑皮肤瘙痒、红斑、肿胀，严重时会出现水疱，甚至波及眼球，引起结膜充血水肿。而且，术后若不注意护理，如过早沾水、搔抓眼部，也容易导致创口感染，影响恢复进程，还可能留下疤痕，对眼部外观造成不良影响。
从远期来看，随着时间推移，纹眼线的色料可能会出现晕染、变色等情况。晕染后的眼线会影响眼部美观，而色料变色不仅不美观，若色料渗透到眼部组织深层，还可能对眼部细胞产生不良刺激，长期作用下可能增加眼部病变的潜在风险。此外，若后期想要通过激光等方式去除纹眼线，同样存在损伤眼部皮肤和组织的可能性。