飞秒激光和准分子激光在多个方面存在区别，主要包括激光性质、手术方式、手术优势、穿透力等方面。
1、激光性质不同：
- 飞秒激光是一种脉冲形式的激光，持续时间非常短，具有极高的瞬时功率，且能聚焦到比头发直径还要小的空间区域内。
- 准分子激光是一种远紫外冷激光，无热效应，是方向性强、波长纯度高、输出功率大的脉冲激光。
2、手术方式不同：
- 飞秒激光在角膜上进行立体切割，制作成合适的角膜基质透镜，再由微小的角膜切口取出透镜，全程不揭瓣，手术更为精准。
- 准分子激光需要先制作角膜瓣，通常选用不同直径的上皮环钻分离角膜边缘，形成角膜瓣，然后用准分子激光切削角膜基质层。
3、手术优势不同：
- 飞秒激光由于全程不揭瓣，手术更为精准，手术后视力恢复快，用药时间短、副作用少，可提高视觉质量，但价格相对较高。
- 准分子激光虽然手术过程中需要制作角膜瓣，但仍是临床上应用比较普遍、安全、快捷、有效、稳定的屈光不正治疗方法。
4、穿透力不同：
- 飞秒激光穿透力比较强，能轻易将电子脱离原子的束缚，形成等离子体。
- 准分子激光穿透力微弱，但波长短，不会穿透人的眼角膜，对于眼球内部的组织没有任何不良的作用。
飞秒激光和准分子激光各有优缺点，对于需要进行此类手术的人群，在选择手术方式时，应根据具体情况和需求进行综合考虑。