若保存方法得当，隔夜的木薯糖水没有出现变质，一般是可以食用的。如果保存方法不当，已经发生变质，则不可以吃。低温且密封的环境能够抑制微生物的滋生与繁殖，木薯糖水富含糖类、淀粉以及一定量的水分，这些物质在常温下极易成为细菌、霉菌等微生物的理想培养基。
- 但在低温条件下，例如冰箱冷藏室2-6℃的环境中，微生物的新陈代谢速度会显著减缓，其摄取木薯糖水中营养成分并进行分解的进程受阻，从而降低了糖水变质的风险。同时密封保存可防止外界空气中的微生物、灰尘等污染物进入，进一步保障了木薯糖水的品质。在这种良好的保存状态下，木薯糖水的营养成分基本能维持原有状态，口感虽可能会有细微变化，但仍可安全食用。
- 若保存方法不当，木薯糖水已经发生变质，当木薯糖水处于高温环境中，如在炎热的夏季，室内温度长时间高于30℃，微生物会迅速在糖水中大量滋生。细菌分解糖水中的糖类和淀粉，会产生各种不良气味和物质。
例如大肠杆菌等细菌在代谢过程中会产生挥发性脂肪酸，使得木薯糖水出现酸臭味。而且微生物的过度繁殖还可能改变糖水的理化性质，导致分层、浑浊等现象。更为严重的是，一些微生物会分泌毒素，如金黄色葡萄球菌产生的肠毒素，即使经过简单加热也难以完全灭活。一旦人体摄入含有这些毒素的变质木薯糖水，会刺激胃肠道黏膜，引发呕吐、腹泻、腹痛等急性胃肠道症状，严重影响身体健康。
不适合食用保存良好隔夜木薯糖水的人群
1、胃肠道疾病患者：患有胃炎、胃溃疡、肠炎等胃肠道疾病的人群，其胃肠道黏膜较为脆弱，对食物的耐受性差。即使木薯糖水只有轻微变质，饮用后也容易引发胃肠道不适，加重病情，如导致胃痛加剧、腹泻次数增多等。
2、免疫力低下者：长期服用免疫抑制剂、患有免疫系统疾病或处于疾病康复期的人群，免疫系统功能较弱，难以有效抵御变质木薯糖水中微生物及毒素的侵害。食用可能变质的糖水，容易引发感染，出现发热、乏力等症状，不利于身体健康恢复。