甲流后腿疼有可能是肌炎，但也可能是其他原因导致的。甲流病毒感染人体后，除了引起呼吸道症状外，还可能引发一系列并发症，其中就包括肌炎。病毒可能直接侵犯肌肉组织，或者通过免疫反应介导对肌肉造成损伤。当肌肉发生炎症时，会出现疼痛、肿胀、无力等症状。
甲流相关肌炎导致的腿疼通常较为明显，可能会影响到患者的正常行走和活动。疼痛一般为双侧性，可累及大腿、小腿等多个部位的肌肉。部分患者还可能伴有肌肉压痛，在按压腿部肌肉时疼痛加剧。严重时，肌肉力量会明显下降，甚至出现肌肉萎缩的情况。此外，患者可能还会有发热、乏力等全身症状，与甲流感染后的整体表现相呼应。
甲流感染期间，患者可能会因为发热、身体不适而减少活动量。当病情逐渐恢复，开始增加活动时，由于长时间不运动，腿部肌肉在运动后容易产生乳酸堆积，从而引起腿疼。这种疼痛通常在活动后加重，休息后可逐渐缓解，一般不伴有肌肉肿胀和无力等症状。
甲流感染可能会引起全身炎症反应，导致关节出现疼痛，有时可能会被误认为是腿疼。关节疼痛通常集中在膝关节、髋关节等部位，可伴有肿胀、活动受限等症状。与肌炎导致的腿疼不同，关节疼痛在按压关节周围时疼痛明显，而不是肌肉部位。
部分患者在感染甲流后，由于对疾病的担忧和焦虑，可能会出现心理性的疼痛感知增强。这种腿疼往往缺乏明确的器质性病变基础，疼痛程度和部位可能会随着患者的情绪变化而有所波动。
如果腿疼症状持续不缓解、加重，或者伴有肌肉无力、肿胀、发热等其他异常表现，应及时就医，进行相关检查，如肌酸激酶、肌电图等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在甲流康复期间，患者应注意休息，避免过度劳累，逐渐增加活动量，以促进身体的恢复。