通常情况下，2个月宝宝大便有病毒可通过一般治疗、药物治疗进行处理。建议在医生的指导下，根据宝宝病情的严重情况来选择合适的治疗措施，切忌擅自用药，以免贻误病情。
1、一般治疗：2个月宝宝大便有病毒，此时通常会出现腹泻等不适症状。如果是母乳喂养的宝宝建议按需喂养，以奶粉为主的宝宝，建议避免食用无乳糖或低乳糖的奶粉。如果宝宝呕吐频繁，建议可等呕吐减轻或停止后再喂奶。同时需要做好宝宝的腹部保暖措施，避免着凉，及时添加衣物；
2、药物治疗：2个月宝宝大便有病毒，说明身体受到了病毒感染，此时可在医生的指导下口服双歧杆菌三联活菌散、蒙脱石散以及利巴韦林颗粒等药物进行治疗。