HPV感染在多数情况下是隐匿的，即患者可能没有任何明显的症状或感觉。尽管大多数HPV感染无症状，但某些类型的HPV，特别是高危型，如HPV16和HPV18，长期感染可能导致宫颈细胞发生变化，如生殖器疣、宫颈癌前病变。
1、生殖器疣：生殖器疣是低危型HPV感染最常见的临床表现之一。这些疣体通常出现在生殖器区域，包括阴茎、阴囊、会阴、肛周以及女性的外阴、阴道口、宫颈等处。生殖器疣可能表现为单个或多个的小而柔软的突起，颜色可能与周围皮肤相近或稍深。患者可能会感到瘙痒、疼痛或不适感，尤其是在疣体受到摩擦或挤压时。
2、宫颈癌前病变：高危型HPV持续感染是宫颈癌的主要致病因素。虽然宫颈癌前病变，如宫颈上皮内瘤变CIN在早期可能没有明显症状，但随着病情的发展，患者可能会出现一些非特异性的症状，如阴道不规则出血，如性交后出血、绝经后出血等，以及阴道分泌物增多并伴有异味、下腹或腰骶部疼痛等。这些症状的出现往往提示病情已经较为严重，需要及时就医。
除了生殖器区域外，HPV还可能感染其他部位，如口腔、咽喉等，这些部位的HPV感染可能表现为口腔或咽喉部的疣体，患者可能会感到疼痛、吞咽困难或声音嘶哑等症状。然而，这些症状相对较少见，且容易被误诊为其他疾病。