氯雷他定和孟鲁司特钠都是临床上常用的治疗过敏性疾病的药物，但在作用机制、适应症以及不良反应等方面均存在显著差异。
1、作用机制不同：
氯雷他定属于抗组胺药物，主要通过选择性地拮抗外周H1受体，从而发挥抗过敏作用。孟鲁司特钠属于白三烯受体拮抗剂，主要通过与白三烯受体结合，阻断白三烯的作用，从而发挥抗炎、抗过敏作用。
2、适应证不同：
氯雷他定主要用于缓解过敏性鼻炎有关的症状，如喷嚏、流涕、鼻痒、鼻塞以及眼部痒及烧灼感。也可用于缓解慢性荨麻疹、瘙痒性皮肤病及其他过敏性皮肤病的症状及体征。孟鲁司特钠适用于1岁以上儿童哮喘的预防和长期治疗，包括预防白天和夜间的哮喘症状，治疗对阿司匹林敏感的哮喘患者以及预防运动诱发的支气管收缩。也可用于减轻过敏性鼻炎引起的症状，如季节性过敏性鼻炎和常年性过敏性鼻炎。
3、不良反应不同：
氯雷他定常见的不良反应有乏力、头痛、嗜睡、口干、胃肠道不适等。一般症状较轻，停药后可自行缓解。罕见的不良反应有过敏反应、肝功能异常、心动过速等。如果出现严重的不良反应，应立即停药并就医。孟鲁司特钠一般耐受性良好，不良反应轻微，通常不需要停药。常见的不良反应有头痛、腹痛、嗜睡等。
在临床应用中，医生会根据患者的具体病情、年龄、身体状况等因素选择合适的药物。患者在使用这两种药物时，应严格按照医生的建议用药，不得自行增减剂量或停药。如果出现不良反应，应及时就医。