革兰氏阴性菌和阳性菌是常见的两种细菌类型，可以从染色、细菌结构、致病因素等方面进行区别。
1、染色不同
先用结晶紫染液（紫色）将所有细胞都染成紫色，再用碘液媒染，之后再用95%酒精脱色，此时，有的细菌不被脱色，仍保留紫色，有的细菌易被脱去紫色，变成无色，最后用沙黄液（红色）复染，已被脱色的细菌染成红色，未被脱色的细菌仍为紫色。经过这一方法染成紫色的细菌，称为革兰氏阳性菌，染成红色的称为革兰氏阴性菌。
2、细菌结构不同
革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌的细胞壁都含有粘肽，但革兰氏阳性菌含粘肽多，革兰氏阴性菌含粘肽少；革兰氏阳性菌粘肽外面有一层磷壁酸物质，革兰氏阴性菌粘肽外面有由脂蛋白、脂多糖和球蛋白组成的数层结构。
3、致病因素不同
大多数革兰氏阳性菌的致病物质主要为外毒素；而大多数革兰氏阴性菌的致病物质主要为内毒素。
4、选择抗菌药物不同
革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌在细胞壁等结构上差别很大，因而对抗生素的敏感性不一，大多数革兰氏阳性菌对青霉素敏感，而大多数革兰氏阴性菌对青霉素不敏感，可供临床实践中选用抗菌药物时参考。
5、细菌种类不同
常见革兰氏阳性菌包括肺炎双球菌、葡萄球菌、链球菌、炭疽杆菌；常见的革兰氏阴性菌包括大肠杆菌、变形杆菌、痢疾杆菌等。
革兰氏阴性菌和阳性菌异常增多均可引起人体患病，若出现身体不适可前往医院治疗。