硝呋太尔杀灭真菌的时间因人而异，受到多种因素的影响。一般来说，单纯的真菌感染可以需要1-2周的时间，而复杂的真菌感染则需要更长的时间。
对于单纯性的阴道真菌感染，使用硝呋太尔进行治疗，在规范用药的情况下，可能需要1-2周的时间来达到较好的治疗效果，即基本杀灭真菌并缓解相关症状。比如，患者每天按照医嘱使用硝呋太尔制霉素阴道软胶囊，每晚1粒，放入阴道深处，通常在用药1周后，阴道分泌物增多、瘙痒、灼痛等症状会有所减轻，连续使用2周后，多数患者的真菌可被有效抑制甚至杀灭，通过阴道分泌物检查可能已无法检测到真菌。
但如果是复杂性的阴道真菌感染，例如患者存在糖尿病等基础疾病，或者是反复感染、免疫力低下等情况，杀灭真菌所需的时间可能会延长。可能需要连续使用硝呋太尔2-3周，甚至更长时间，并且在症状消失后，还需要巩固治疗一段时间，以防止真菌复发。
此外，不同剂型的硝呋太尔以及不同的用药方式也会对杀灭真菌的时间产生影响。除了阴道用的软胶囊外，还有硝呋太尔口服制剂等。口服硝呋太尔一般用于全身真菌感染的治疗，其在体内的代谢和作用过程与局部用药有所不同，对于一些深部真菌感染，可能需要连续服用数周才能有效杀灭真菌。
而且，个体对药物的吸收、代谢以及敏感性也存在差异。有些患者对硝呋太尔较为敏感，药物能迅速发挥作用，较短时间内就能控制真菌感染；而有些患者可能对药物的反应相对较慢，需要更长时间的用药才能达到相同的效果。同时，患者在用药期间是否严格遵守医嘱，如是否保持外阴清洁、避免性生活、按时按量用药等，也会影响硝呋太尔杀灭真菌的时间。如果患者未能严格遵循医嘱，可能会导致治疗时间延长，甚至治疗失败。