脚边上骨头突出还疼可能是由腱鞘囊肿、拇囊炎和骨关节炎以及痛风性关节炎等多种原因导致的，具体原因需要根据患者的具体情况和医生的诊断来确定。
1、穿鞋不当：经常穿过紧的鞋子，脚部与鞋子反复摩擦，也可能会出现脚边上骨头突出而且疼的症状。
2、外伤：患者的脚不小心踢到重物后，由于软组织出现损伤，不仅因为红肿使脚边骨头看上去有些突出，还可能会出现疼痛、瘀青等症状。
3、腱鞘囊肿：腱鞘囊肿是发生于关节部腱鞘内的囊性肿物，好发于腕背侧、足背等部位，患者可能因此疾病导致脚边骨头处长有一个圆形的囊肿，不仅突出，偶尔还会感到轻度压痛。
4、拇囊炎：拇囊炎由行走时足部过度内旋、长时间挤压脚趾等因素所导致，会因为拇趾向内弯曲导致脚边骨头看上去突出了，并且患者还可能会出现大脚趾疼痛、关节肿胀压痛等情况。
5、骨关节炎：骨关节炎多见于老年人，随着年龄的增长，关节软骨逐渐发生磨损，大脚趾的第一跖趾关节磨损后，会出现第一跖趾关节的半脱位，脚边骨头突出并伴有疼痛。
6、痛风性关节炎：好发于高尿酸血症者，由于长时间血尿酸处于高位，尿酸结晶会积聚在大脚趾的内侧从而形成痛风石，大脚趾会突出，而且还有明显的疼痛、发红、肿胀。
患者应穿着合适的鞋子，避免高跟鞋或尖头鞋，使用定制的鞋垫或矫形器来改善足部的生物力学。